カトリック神言修道会を、設立母体とする南山第二学園は、「人間の尊厳のために」という教育目標をもって、立派な人になるように最善を尽します。
「愛徳」と「努力」の精神にしたがい立派な人になるように最善を尽します。
宗教的情操教育による心の育成や個性や社会性の育成に努めます。
安心して学習やその他の活動に取り組むことができるように努めます。